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基因芯片

簡要描述:基因芯片廣泛用于模式物種的DNA、RNA和表觀遺傳等研究。豐核信息提供SNP芯片、RNA芯片、甲基化芯片分析服務,涵蓋人類和主要模式物種。

  • 更新時間:2022-12-22
  • 瀏覽次數:941

詳細介紹

項目分類名稱描述
Illumina SNP芯片Human omni-zhonghua-8 beachip包含90萬個位點
Agilent表達譜芯片Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60K V2涵蓋50,599條轉錄本信息
Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8×60K涵蓋55,681條轉錄本信息
Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8×60K涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs
Agilent miRNA芯片Agilent Human miRNA Array V19.0覆蓋2006個人類相關miRNA
Agilent Rat miRNA Arrary V19.0覆蓋719個大鼠相關miRNA
Agilent Mouse miRNA Array V19.0覆蓋1247個小鼠相關miRNA
Agilent 定制miRNA Array V19.0可以定制數據庫包含的各個物種的相關miRNA
Illumina人DNA甲基化芯片服務IlluminaInfinium Human Methylation450 BeadChip包含了450,000多個甲基化位

 

 數據分析(以miRNA芯片分析為例)

 

標準分析

芯片預處理與標準化;

篩選差異表達microRNA;

microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等;

microRNA靶基因預測,基于多數據庫整合的靶基因預測以及上海豐核自主知識產權的預測軟件同時識別;

對預測的microRNA的靶基因進行GO富集分析通路富集分析等。

 

個性化分析

1.microRNA網絡分析:microRNA靶基因失調網絡;microNRA功能協同作用網絡。

2.microRNA與其他芯片整合分析:與lncRNAs芯片結果聯合分析(ceRNA Analysis);與mRNA芯片整合分析;與DNA甲基化芯片結果聯合分析。

3.與臨床數據整合分析

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